根据新个税法的规定，如果已扣除各项社保费用，40000工资所扣税费为6090元。 计算步骤： 月薪40000扣除个人所得税算法如下： 1.应纳税所得额 = 工资收入金额 － 各项社会保险费 － 起征点(5000元) 2.应纳税所得额 = 40000 - 0 - 5000 = 35000 3.应纳税额 = 应纳税所得额 x 税率 － 速算扣除数 4.应纳税额 = 35000 x 25% - 2660 = 6090
《中华人民共和国个人所得税法》第十一条居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。 居民个人向扣缴义务人提供专项附加扣除信息的，扣缴义务人按月预扣预缴税款时应当按照规定予以扣除，不得拒绝。 非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款，不办理汇算清缴。
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