法律分析：劳动法规定的扣薪上限有两个原则， 1是最后不能低于当地最低工资水平。，2是每个月工资不能扣到超过原本工资的20% 因此如果因为公司章程中有规定，上班迟到可以扣工资，则也应当在法律规定进行，不能任意克扣。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
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